LTQ Orbitrap是整合了LTQ線性離子阱質譜儀和軌道阱質量分析器的組合式高分辨質譜儀系統(tǒng)。大氣壓離子源處產生的離子在LTQ質量分析器被捕獲。而一旦處于離子阱中，這些離子就可以通過LTQ的MS或MSn等掃描模式進行分析。然后，離子從LTQ軸向排出，進入一個C-形離子阱(C-trap)，再經過C-trap進入Orbitrap質量分析器。通過快速增加Orbitrap中心電極的電壓可將C-trap來的離子捕獲，捕獲的離子圍繞中心電極做環(huán)形運動并沿中心電極軸向振動。
來自軌道阱外電極的信號經過擴增后，通過快速傅立葉變換轉換為頻率。另外LTQ Orbitrap XL還有一個新型碰撞池能夠提供任何的二級質譜實驗。離子被選擇性的保留在線性離子阱中，可以通過離子阱碰撞誘導解離技術或者新型高能誘導技術斷裂。高能碰撞誘導解離離子經過C-trap到達充滿氣體的碰撞池。高能誘導解離的二級質譜實驗中，標準化的碰撞能量可以在不同的儀器之間提供重復的數(shù)據(jù)。
LTQ ORBITRAP XL提供
高質量準確度，低假陽性率
高靈敏度，寬動態(tài)范圍可鑒定更多的蛋白
高效的平行檢測模式
二級質譜高靈敏度
可以升級的組件包括電子轉移裂解(ETD) 和MALDI功能
技術參數(shù)：
LTQ Orbitrap XL ETD提供：
利用多重活化類型（activation types)和數(shù)據(jù)依賴決策樹（Data Dependent Decision Tree）的高度可靠的蛋白質鑒定功能。
平行獲取能力和高通量測序應用
利用高分辨率和高精密度的質譜鑒定未預期的PTMs
廣范圍定量性能，包括低豐度肽段
對于大肽段和蛋白質分析：
高分辨率和高質譜保障復雜ETD譜圖分析
為前體和碎片離子提供清晰的電荷狀態(tài)鑒定
ProSigntPC軟件適用于自動數(shù)據(jù)挖掘（Data Mining)
通過LC/MS為肽段測序進行數(shù)據(jù)依賴決策樹（Data Dependent Decision Tree）分析
增加鑒定的肽段數(shù)目而不增加實驗時間
根據(jù)肽段特性（電荷狀態(tài)，荷質比m/z等等）自動提供優(yōu)化的碎片解離技術選擇，確保達到效解離
Proteome Discoverer 軟件平臺提供定性和定量數(shù)據(jù)分析
互補性的ETD、CID和HCD分析提供清晰的從頭測序
主要特點：
基于快速、高靈敏的Thermo Scientific 線性離子阱和自主的Orbitrap技術，LTQ Orbitrap XL組合型傅立葉變換高分辨質譜無論是對常規(guī)化合物鑒定，還是嚴格復雜體系內痕量組分的分析，都能應對自如。
LTQ ORBITRAP XL –超凡的性能和易用性
新型高能碰撞誘導解離池對于蛋白質組學和小分子研究及其方便易用
可以升級的組件包括電子轉移裂解(ETD) 和MALDI功能
Thermo Scientific LTQ Orbitrap XL ETD組合型傅里葉變換高分辨質譜儀是當前用于蛋白質分析的有效儀器，完美地將三種不同而具有互補性的碎片解離技術---CID, HCD和ETD能集于一身。
基于深受贊譽的Orbitrap技術，Thermo Scientific LTQ Orbitrap XL ETD組合型傅里葉變換高分辨質譜儀為蛋白質分析的各項需求提供了全面的解決方案，包括：復雜PTM分析、肽段智能測序、從上到下（top-down）和從中到下（middle-down）分析，和通過穩(wěn)定同位素標記如：TMT、iTRAQ進行蛋白質定量分析或者無標記蛋白質定量分析等等。